Aqui é onde todos os criminosos que os ninjas de Konoha capturaram, vão ficar. A prisão de Konoha é um lugar escuro e silencioso, muito diferente da vila. Há rumores de que alguns prisioneiros chegaram a se matar por terem perdido a sanidade, depois de passar muito tempo aqui. Pelo corredor, as vezes pode-se escutar o choro de algum criminoso ecoando pelo lugar, alguns shinobis de Konoha ficam vigiando o local.